Protein–RNA interactions for Protein: O75452

RDH16, Retinol dehydrogenase 16, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH16O75452 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RDH16O75452 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RDH16O75452 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH16O75452 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH16O75452 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH16O75452 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH16O75452 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH16O75452 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH16O75452 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH16O75452 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH16O75452 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH16O75452 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH16O75452 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH16O75452 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH16O75452 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH16O75452 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH16O75452 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH16O75452 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH16O75452 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH16O75452 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH16O75452 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH16O75452 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH16O75452 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH16O75452 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH16O75452 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH16O75452 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH16O75452 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH16O75452 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH16O75452 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH16O75452 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH16O75452 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH16O75452 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH16O75452 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH16O75452 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH16O75452 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH16O75452 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH16O75452 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH16O75452 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH16O75452 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH16O75452 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH16O75452 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH16O75452 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH16O75452 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH16O75452 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH16O75452 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH16O75452 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH16O75452 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH16O75452 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH16O75452 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH16O75452 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH16O75452 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH16O75452 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RDH16O75452 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RDH16O75452 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RDH16O75452 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RDH16O75452 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RDH16O75452 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RDH16O75452 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RDH16O75452 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
RDH16O75452 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RDH16O75452 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RDH16O75452 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RDH16O75452 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RDH16O75452 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RDH16O75452 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RDH16O75452 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RDH16O75452 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RDH16O75452 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RDH16O75452 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RDH16O75452 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RDH16O75452 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RDH16O75452 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RDH16O75452 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RDH16O75452 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RDH16O75452 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RDH16O75452 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RDH16O75452 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RDH16O75452 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RDH16O75452 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RDH16O75452 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RDH16O75452 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RDH16O75452 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RDH16O75452 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RDH16O75452 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RDH16O75452 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RDH16O75452 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RDH16O75452 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RDH16O75452 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RDH16O75452 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RDH16O75452 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RDH16O75452 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RDH16O75452 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RDH16O75452 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RDH16O75452 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RDH16O75452 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RDH16O75452 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RDH16O75452 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RDH16O75452 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RDH16O75452 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RDH16O75452 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms