Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms