Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SEMA3CQ99985 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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