Protein–RNA interactions for Protein: Q5RL73

RBM48, RNA-binding protein 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM48Q5RL73 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RBM48Q5RL73 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.4 ms