Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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