Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFWD3Q6PCD5 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms