Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms