Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COL4A6Q14031 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms