Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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LAMB3Q13751 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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LAMB3Q13751 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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LAMB3Q13751 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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LAMB3Q13751 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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LAMB3Q13751 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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LAMB3Q13751 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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LAMB3Q13751 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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LAMB3Q13751 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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LAMB3Q13751 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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LAMB3Q13751 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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