Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms