Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG7O95352 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG7O95352 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG7O95352 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG7O95352 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG7O95352 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG7O95352 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG7O95352 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG7O95352 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG7O95352 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG7O95352 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG7O95352 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG7O95352 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG7O95352 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG7O95352 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG7O95352 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG7O95352 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG7O95352 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms