Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LMO4P61968 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LMO4P61968 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LMO4P61968 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LMO4P61968 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LMO4P61968 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
LMO4P61968 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LMO4P61968 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LMO4P61968 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms