Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN1P49257 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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