Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms