Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO2P25791 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO2P25791 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO2P25791 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO2P25791 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO2P25791 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO2P25791 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO2P25791 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO2P25791 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms