Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGP37231 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms