Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETSIPP0DME0 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms