Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDN1P05305 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDN1P05305 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDN1P05305 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EDN1P05305 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDN1P05305 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDN1P05305 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDN1P05305 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDN1P05305 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDN1P05305 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDN1P05305 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDN1P05305 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDN1P05305 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDN1P05305 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDN1P05305 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDN1P05305 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDN1P05305 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDN1P05305 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDN1P05305 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDN1P05305 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDN1P05305 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDN1P05305 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDN1P05305 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDN1P05305 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDN1P05305 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDN1P05305 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDN1P05305 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDN1P05305 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDN1P05305 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDN1P05305 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDN1P05305 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDN1P05305 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDN1P05305 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDN1P05305 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDN1P05305 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDN1P05305 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDN1P05305 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDN1P05305 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDN1P05305 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDN1P05305 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDN1P05305 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDN1P05305 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDN1P05305 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDN1P05305 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDN1P05305 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDN1P05305 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDN1P05305 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EDN1P05305 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms