Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms