Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAMB3Q13751 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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