Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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TCIRG1Q13488 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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TCIRG1Q13488 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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TCIRG1Q13488 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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TCIRG1Q13488 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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TCIRG1Q13488 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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TCIRG1Q13488 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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TCIRG1Q13488 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
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