Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms