Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RAB18Q9NP72 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms