Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL17Q6UXB2 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms