Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms