Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms