Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC1O14908 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC1O14908 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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