Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CNTN3Q9P232 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CNTN3Q9P232 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CNTN3Q9P232 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CNTN3Q9P232 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CNTN3Q9P232 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CNTN3Q9P232 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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