Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms