Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms