Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.031e-7■□□□□ 11
PCBP2Q15366 SYMPK-204ENST00000593959 546 ntTSL 415.31■□□□□ 0.049e-8■□□□□ 11
PCBP2Q15366 AKAP1-203ENST00000481416 4089 ntTSL 59.76□□□□□ -0.859e-7■□□□□ 11
PCBP2Q15366 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.542e-10■□□□□ 11
PCBP2Q15366 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.482e-10■□□□□ 11
PCBP2Q15366 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.312e-10■□□□□ 11
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PCBP2Q15366 RNF121-206ENST00000525243 812 ntTSL 211.51□□□□□ -0.572e-10■□□□□ 11
PCBP2Q15366 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.792e-6■□□□□ 11
PCBP2Q15366 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.32e-6■□□□□ 11
PCBP2Q15366 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.062e-6■□□□□ 11
PCBP2Q15366 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.376e-8■□□□□ 11
PCBP2Q15366 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.036e-8■□□□□ 11
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PCBP2Q15366 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.531e-9■□□□□ 11
PCBP2Q15366 PPME1-202ENST00000398427 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.651e-9■□□□□ 11
PCBP2Q15366 PPME1-205ENST00000539021 4055 ntTSL 28.52□□□□□ -1.051e-9■□□□□ 11
PCBP2Q15366 PPME1-206ENST00000541340 3618 ntTSL 1 (best)6.69□□□□□ -1.341e-9■□□□□ 11
PCBP2Q15366 CHML-202ENST00000636025 371 ntTSL 46.32□□□□□ -1.41e-9■□□□□ 11
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PCBP2Q15366 HNRNPA2B1-202ENST00000356674 1711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.631e-7■□□□□ 11
PCBP2Q15366 SLC29A4-205ENST00000439491 805 ntTSL 313.91□□□□□ -0.188e-16■□□□□ 11
PCBP2Q15366 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.075e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.015e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 PPT2-EGFL8-207ENST00000585246 1051 ntAPPRIS ALT2 TSL 220.05■□□□□ 0.85e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 PPT2-EGFL8-201ENST00000421600 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 518.04■□□□□ 0.485e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.445e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 PPT2-EGFL8-206ENST00000583227 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.96■□□□□ 0.35e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.295e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 PPT2-EGFL8-204ENST00000453656 1327 ntTSL 216.01■□□□□ 0.155e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 PPT2-EGFL8-203ENST00000428388 2878 ntAPPRIS P5 TSL 215.5■□□□□ 0.075e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.145e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.315e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 PPT2-EGFL8-205ENST00000479001 944 ntTSL 510.42□□□□□ -0.745e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 CPNE1-216ENST00000437340 1755 ntTSL 1 (best)25.37■■□□□ 1.651e-7■□□□□ 10.9
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PCBP2Q15366 RBM12-204ENST00000424458 1068 ntTSL 224■■□□□ 1.433e-16■□□□□ 10.9
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PCBP2Q15366 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.297e-8■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.287e-8■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 LGMN-217ENST00000557609 1832 ntTSL 516.56■□□□□ 0.247e-8■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 LGMN-210ENST00000555169 543 ntTSL 216.19■□□□□ 0.187e-8■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.127e-8■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.033e-16■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 CPNE1-208ENST00000414711 673 ntTSL 514.92□□□□□ -0.023e-16■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.033e-16■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 CPNE1-215ENST00000437100 826 ntTSL 514.19□□□□□ -0.143e-16■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.533e-16■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 LGMN-219ENST00000557725 741 ntTSL 210.6□□□□□ -0.717e-8■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 CPNE1-214ENST00000435747 400 ntTSL 39.85□□□□□ -0.833e-16■□□□□ 10.9
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PCBP2Q15366 AL109827.1-201ENST00000454607 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 29.49□□□□□ -0.893e-16■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.933e-16■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.058e-7■□□□□ 10.9
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PCBP2Q15366 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.468e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.271e-7■□□□□ 10.9
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PCBP2Q15366 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.917e-11■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.861e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.791e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 ASS1-205ENST00000422569 807 ntTSL 519.87■□□□□ 0.771e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.691e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.391e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.381e-7■□□□□ 10.9
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PCBP2Q15366 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.237e-11■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 CALD1-209ENST00000436461 1614 ntTSL 516.18■□□□□ 0.181e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.144e-12■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 TMEM179B-204ENST00000532586 839 ntTSL 215.76■□□□□ 0.111e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.021e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.021e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 04e-12■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.071e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 CALD1-208ENST00000435928 458 ntTSL 514.38□□□□□ -0.111e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 CALD1-212ENST00000454108 558 ntTSL 514.38□□□□□ -0.111e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.154e-12■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 CALD1-207ENST00000430085 1938 ntTSL 214.05□□□□□ -0.161e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 ABHD14B-205ENST00000473912 477 ntTSL 212.75□□□□□ -0.371e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 IL1RN-204ENST00000409052 1903 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.374e-12■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.381e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 DUSP7-201ENST00000469623 3059 ntTSL 212.34□□□□□ -0.431e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 POLR3A-202ENST00000472014 699 ntTSL 311.73□□□□□ -0.531e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 ASS1-206ENST00000443588 545 ntTSL 510.69□□□□□ -0.71e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 CALD1-211ENST00000445569 525 ntTSL 510.3□□□□□ -0.761e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 CALD1-210ENST00000443197 4173 ntTSL 510.27□□□□□ -0.771e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 CALD1-203ENST00000393118 4281 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.771e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 TMEM179B-203ENST00000532345 845 ntTSL 29.4□□□□□ -0.91e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 POLR3A-201ENST00000372371 6640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.981e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 CALD1-220ENST00000482470 3941 ntTSL 28.89□□□□□ -0.991e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 CALD1-202ENST00000361901 4114 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -11e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 CALD1-201ENST00000361675 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.021e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 ARHGAP26-204ENST00000418236 1632 ntTSL 1 (best)8.31□□□□□ -1.081e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 ARHGAP26-210ENST00000443674 2870 ntTSL 57.03□□□□□ -1.281e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 PAPD5-201ENST00000357464 7233 ntTSL 56.49□□□□□ -1.371e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.531e-7■□□□□ 10.9
PCBP2Q15366 CALD1-221ENST00000489019 422 ntTSL 53.4□□□□□ -1.871e-7■□□□□ 10.9
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