Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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