Protein–RNA interactions for Protein: U3KQK5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQK5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQK5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQK5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQK5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U3KQK5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQK5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQK5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQK5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQK5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQK5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQK5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQK5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U3KQK5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
U3KQK5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQK5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQK5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQK5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQK5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQK5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQK5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQK5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQK5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQK5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQK5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQK5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQK5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQK5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQK5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQK5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U3KQK5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
U3KQK5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
U3KQK5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
U3KQK5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
U3KQK5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
U3KQK5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
U3KQK5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
U3KQK5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
U3KQK5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
U3KQK5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
U3KQK5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
U3KQK5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
U3KQK5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
U3KQK5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQK5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQK5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQK5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQK5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQK5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQK5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQK5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQK5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQK5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQK5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQK5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQK5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
U3KQK5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQK5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQK5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQK5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQK5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQK5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQK5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQK5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQK5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQK5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQK5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQK5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQK5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQK5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQK5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U3KQK5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
U3KQK5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
U3KQK5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
U3KQK5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
U3KQK5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
U3KQK5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
U3KQK5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
U3KQK5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
U3KQK5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
U3KQK5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQK5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQK5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQK5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQK5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQK5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQK5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQK5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQK5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQK5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQK5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQK5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQK5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQK5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQK5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQK5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
U3KQK5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
U3KQK5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
U3KQK5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
U3KQK5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
U3KQK5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms