Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF18Q9Y5U5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms