Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMCO1Q9UM00 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms