Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIF3KQ9UBQ5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EIF3KQ9UBQ5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EIF3KQ9UBQ5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EIF3KQ9UBQ5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EIF3KQ9UBQ5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EIF3KQ9UBQ5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EIF3KQ9UBQ5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EIF3KQ9UBQ5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EIF3KQ9UBQ5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EIF3KQ9UBQ5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EIF3KQ9UBQ5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EIF3KQ9UBQ5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EIF3KQ9UBQ5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EIF3KQ9UBQ5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EIF3KQ9UBQ5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EIF3KQ9UBQ5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EIF3KQ9UBQ5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EIF3KQ9UBQ5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms