Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRM3Q9NNZ6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRM3Q9NNZ6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRM3Q9NNZ6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRM3Q9NNZ6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRM3Q9NNZ6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRM3Q9NNZ6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRM3Q9NNZ6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRM3Q9NNZ6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRM3Q9NNZ6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRM3Q9NNZ6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRM3Q9NNZ6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRM3Q9NNZ6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRM3Q9NNZ6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRM3Q9NNZ6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRM3Q9NNZ6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRM3Q9NNZ6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRM3Q9NNZ6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRM3Q9NNZ6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRM3Q9NNZ6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRM3Q9NNZ6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRM3Q9NNZ6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRM3Q9NNZ6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRM3Q9NNZ6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRM3Q9NNZ6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRM3Q9NNZ6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRM3Q9NNZ6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms