Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN2

CNDP1, Beta-Ala-His dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNDP1Q96KN2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNDP1Q96KN2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNDP1Q96KN2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms