Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VN1R17PQ8TDU5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VN1R17PQ8TDU5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VN1R17PQ8TDU5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R17PQ8TDU5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms