Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP2Q8ND30 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms