Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G2

CMTR1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTR1Q8N1G2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CMTR1Q8N1G2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CMTR1Q8N1G2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms