Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TPTE2Q6XPS3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TPTE2Q6XPS3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms