Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDSS1Q5T2R2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDSS1Q5T2R2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms