Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SFT2D3Q587I9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFT2D3Q587I9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms