Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 NAP1L1-203ENST00000431879 2031 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.972e-7■■□□□ 14.3
SRSF7Q16629 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.472e-7■■□□□ 14.3
SRSF7Q16629 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.782e-7■■□□□ 14.3
SRSF7Q16629 NAP1L1-224ENST00000552056 1981 ntTSL 53.76□□□□□ -1.812e-7■■□□□ 14.3
SRSF7Q16629 ARFGAP1-214ENST00000520485 1548 ntTSL 218.81■□□□□ 0.68e-10■■□□□ 14.2
SRSF7Q16629 ARFGAP1-209ENST00000518794 2727 ntTSL 1 (best)15.32■□□□□ 0.048e-10■■□□□ 14.2
SRSF7Q16629 ARFGAP1-208ENST00000518691 1162 ntTSL 214.91□□□□□ -0.028e-10■■□□□ 14.2
SRSF7Q16629 ARFGAP1-205ENST00000468975 2640 ntTSL 214.59□□□□□ -0.078e-10■■□□□ 14.2
SRSF7Q16629 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.168e-10■■□□□ 14.2
SRSF7Q16629 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.168e-10■■□□□ 14.2
SRSF7Q16629 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.228e-10■■□□□ 14.2
SRSF7Q16629 ARFGAP1-213ENST00000520022 558 ntTSL 413.49□□□□□ -0.258e-10■■□□□ 14.2
SRSF7Q16629 ARFGAP1-215ENST00000522403 995 ntTSL 512.81□□□□□ -0.368e-10■■□□□ 14.2
SRSF7Q16629 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.448e-10■■□□□ 14.2
SRSF7Q16629 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.458e-10■■□□□ 14.2
SRSF7Q16629 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.458e-10■■□□□ 14.2
SRSF7Q16629 ARFGAP1-221ENST00000549047 1040 ntTSL 511.8□□□□□ -0.528e-10■■□□□ 14.2
SRSF7Q16629 ARFGAP1-218ENST00000523460 572 ntTSL 411.03□□□□□ -0.648e-10■■□□□ 14.2
SRSF7Q16629 ARFGAP1-206ENST00000518601 905 ntTSL 510.83□□□□□ -0.688e-10■■□□□ 14.2
SRSF7Q16629 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.553e-11■■□□□ 14.2
SRSF7Q16629 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.363e-11■■□□□ 14.2
SRSF7Q16629 NR5A1-201ENST00000373587 768 ntTSL 316.77■□□□□ 0.283e-11■■□□□ 14.2
SRSF7Q16629 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.168e-8■■□□□ 14.2
SRSF7Q16629 IGF2R-203ENST00000475584 597 ntTSL 312.04□□□□□ -0.481e-16■■□□□ 14.2
SRSF7Q16629 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.511e-16■■□□□ 14.2
SRSF7Q16629 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.893e-8■■□□□ 14.2
SRSF7Q16629 NAP1L1-213ENST00000548044 1339 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.173e-8■■□□□ 14.2
SRSF7Q16629 BIRC5-208ENST00000590925 648 ntTSL 1 (best)13.87□□□□□ -0.192e-7■■□□□ 14.1
SRSF7Q16629 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.392e-7■■□□□ 14.1
SRSF7Q16629 BIRC5-206ENST00000589892 747 ntTSL 211.45□□□□□ -0.582e-7■■□□□ 14.1
SRSF7Q16629 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.612e-7■■□□□ 14.1
SRSF7Q16629 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.652e-7■■□□□ 14.1
SRSF7Q16629 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.622e-14■■□□□ 14
SRSF7Q16629 SLC39A14-209ENST00000520644 377 ntTSL 515.48■□□□□ 0.072e-14■■□□□ 14
SRSF7Q16629 SLC39A14-212ENST00000524285 570 ntTSL 413.8□□□□□ -0.22e-14■■□□□ 14
SRSF7Q16629 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.642e-14■■□□□ 14
SRSF7Q16629 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.712e-14■■□□□ 14
SRSF7Q16629 SLC39A14-203ENST00000359741 4641 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.842e-14■■□□□ 14
SRSF7Q16629 SRRM2-230ENST00000576924 3314 ntTSL 1 (best)13.85□□□□□ -0.192e-6■■□□□ 14
SRSF7Q16629 SRRM2-208ENST00000571378 2870 ntTSL 1 (best)12.72□□□□□ -0.372e-6■■□□□ 14
SRSF7Q16629 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.162e-6■■□□□ 14
SRSF7Q16629 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.152e-6■■□□□ 14
SRSF7Q16629 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.152e-6■■□□□ 14
SRSF7Q16629 GTF2H4-204ENST00000475845 659 ntTSL 215.77■□□□□ 0.122e-6■■□□□ 14
SRSF7Q16629 GTF2H4-205ENST00000483318 1082 ntTSL 215.77■□□□□ 0.122e-6■■□□□ 14
SRSF7Q16629 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.112e-6■■□□□ 14
SRSF7Q16629 ULK1-204ENST00000540647 1211 ntTSL 215.46■□□□□ 0.072e-6■■□□□ 14
SRSF7Q16629 VARS2-209ENST00000477288 6054 ntTSL 215.41■□□□□ 0.062e-6■■□□□ 14
SRSF7Q16629 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 02e-6■■□□□ 14
SRSF7Q16629 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.182e-6■■□□□ 14
SRSF7Q16629 SLCO4A1-207ENST00000495889 543 ntTSL 313.2□□□□□ -0.32e-6■■□□□ 14
SRSF7Q16629 ULK1-205ENST00000541761 1262 ntTSL 212.65□□□□□ -0.382e-6■■□□□ 14
SRSF7Q16629 SLCO4A1-208ENST00000497209 3092 ntTSL 1 (best)12.65□□□□□ -0.382e-6■■□□□ 14
SRSF7Q16629 SLCO4A1-205ENST00000466961 819 ntTSL 311.41□□□□□ -0.582e-6■■□□□ 14
SRSF7Q16629 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.582e-6■■□□□ 14
SRSF7Q16629 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.592e-6■■□□□ 14
SRSF7Q16629 SLCO4A1-203ENST00000451793 856 ntTSL 210.83□□□□□ -0.682e-6■■□□□ 14
SRSF7Q16629 STAT3-213ENST00000588969 2772 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.782e-6■■□□□ 14
SRSF7Q16629 STAT3-211ENST00000585517 3319 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.862e-6■■□□□ 14
SRSF7Q16629 TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.972e-6■■□□□ 14
SRSF7Q16629 SLCO4A1-204ENST00000466818 556 ntTSL 37.16□□□□□ -1.262e-6■■□□□ 14
SRSF7Q16629 CTNND1-209ENST00000524579 505 ntTSL 45.53□□□□□ -1.522e-6■■□□□ 14
SRSF7Q16629 FUS-209ENST00000566605 1787 ntTSL 1 (best)22.1■■□□□ 1.132e-25■■□□□ 14
SRSF7Q16629 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.912e-25■■□□□ 14
SRSF7Q16629 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.512e-25■■□□□ 14
SRSF7Q16629 FUS-203ENST00000474990 827 ntTSL 317.45■□□□□ 0.382e-25■■□□□ 14
SRSF7Q16629 FUS-213ENST00000570090 544 ntTSL 213.85□□□□□ -0.192e-25■■□□□ 14
SRSF7Q16629 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.372e-25■■□□□ 14
SRSF7Q16629 FUS-206ENST00000487509 4920 ntTSL 211.21□□□□□ -0.612e-25■■□□□ 14
SRSF7Q16629 CCAR1-203ENST00000479143 478 ntTSL 55.06□□□□□ -1.62e-6■■□□□ 14
SRSF7Q16629 NAP1L1-212ENST00000547993 2481 ntTSL 1 (best)5.14□□□□□ -1.592e-8■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 AP001931.1-201ENST00000531074 580 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.871e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-224ENST00000530068 579 ntTSL 48.59□□□□□ -1.031e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-210ENST00000524630 6553 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.061e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-235ENST00000533189 498 ntTSL 38.31□□□□□ -1.081e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-213ENST00000526357 5994 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.161e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-201ENST00000358694 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.21e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-237ENST00000534579 6024 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.211e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-208ENST00000428599 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.211e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-232ENST00000532649 6026 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.241e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-202ENST00000361332 6295 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.251e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-205ENST00000399050 6313 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.251e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.261e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-215ENST00000526938 3489 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.261e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-221ENST00000529873 5931 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.271e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-227ENST00000530748 5925 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.271e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-206ENST00000415361 5832 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.281e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-225ENST00000530094 5814 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.281e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.321e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.321e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.331e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-220ENST00000529526 6099 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.341e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.351e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.361e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.371e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.371e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.381e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.411e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.441e-6■■□□□ 13.9
SRSF7Q16629 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.461e-6■■□□□ 13.9
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