Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRRQ15256 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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