Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.83e-8■■■■■ 48.4
EFTUD2Q15029 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.383e-8■■■■■ 48.4
EFTUD2Q15029 GIT1-202ENST00000335356 660 ntTSL 326.07■■□□□ 1.763e-9■■■■■ 48.4
EFTUD2Q15029 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.352e-6■■■■■ 48.4
EFTUD2Q15029 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 48.4
EFTUD2Q15029 AC005726.2-203ENST00000584196 2103 ntTSL 220.03■□□□□ 0.89e-9■■■■■ 48.4
EFTUD2Q15029 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 48.4
EFTUD2Q15029 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 48.4
EFTUD2Q15029 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 48.4
EFTUD2Q15029 NDUFS8-214ENST00000531796 615 ntTSL 315.35■□□□□ 0.055e-7■■■■■ 48.4
EFTUD2Q15029 NDUFS8-206ENST00000525628 515 ntTSL 214.81□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 48.4
EFTUD2Q15029 NDUFS8-212ENST00000531228 531 ntTSL 214.12□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 48.4
EFTUD2Q15029 GIT1-213ENST00000583413 546 ntTSL 414.09□□□□□ -0.153e-9■■■■■ 48.4
EFTUD2Q15029 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.269e-9■■■■■ 48.4
EFTUD2Q15029 SGK494-212ENST00000581199 866 ntTSL 1 (best)13.41□□□□□ -0.269e-9■■■■■ 48.4
EFTUD2Q15029 SGK494-201ENST00000301037 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.699e-9■■■■■ 48.4
EFTUD2Q15029 SNHG1-202ENST00000535689 550 ntTSL 22.87□□□□□ -1.952e-44■■■■■ 48.4
EFTUD2Q15029 RPS16-205ENST00000599705 407 ntTSL 39.36□□□□□ -0.912e-7■■■■■ 48.4
EFTUD2Q15029 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.922e-7■■■■■ 48.3
EFTUD2Q15029 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.862e-7■■■■■ 48.3
EFTUD2Q15029 GALK1-206ENST00000589030 866 ntTSL 219.07■□□□□ 0.642e-7■■■■■ 48.3
EFTUD2Q15029 GALK1-208ENST00000592494 1121 ntTSL 518.62■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 48.3
EFTUD2Q15029 GALK1-202ENST00000586244 1180 ntTSL 1 (best)18.11■□□□□ 0.492e-7■■■■■ 48.3
EFTUD2Q15029 ACP2-208ENST00000529788 570 ntTSL 213.74□□□□□ -0.215e-8■■■■■ 48.3
EFTUD2Q15029 ACP2-202ENST00000444355 640 ntTSL 211.93□□□□□ -0.55e-8■■■■■ 48.3
EFTUD2Q15029 ACP2-209ENST00000530453 826 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.575e-8■■■■■ 48.3
EFTUD2Q15029 PANK4-210ENST00000505228 1913 ntTSL 519.08■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 48.3
EFTUD2Q15029 NDRG2-258ENST00000556716 2718 ntTSL 214.1□□□□□ -0.154e-7■■■■■ 48.3
EFTUD2Q15029 NDRG2-218ENST00000553593 978 ntTSL 311.56□□□□□ -0.564e-7■■■■■ 48.3
EFTUD2Q15029 FDXR-208ENST00000578473 2482 ntTSL 1 (best)22.27■■□□□ 1.167e-7■■■■■ 48.3
EFTUD2Q15029 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.987e-7■■■■■ 48.3
EFTUD2Q15029 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.887e-7■■■■■ 48.3
EFTUD2Q15029 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.877e-7■■■■■ 48.3
EFTUD2Q15029 FDXR-206ENST00000577509 1912 ntTSL 220.41■□□□□ 0.867e-7■■■■■ 48.3
EFTUD2Q15029 FDXR-218ENST00000583881 1561 ntTSL 219.96■□□□□ 0.797e-7■■■■■ 48.3
EFTUD2Q15029 FDXR-209ENST00000579482 2157 ntTSL 219.87■□□□□ 0.777e-7■■■■■ 48.3
EFTUD2Q15029 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.747e-7■■■■■ 48.3
EFTUD2Q15029 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.647e-7■■■■■ 48.3
EFTUD2Q15029 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.617e-7■■■■■ 48.3
EFTUD2Q15029 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.587e-7■■■■■ 48.3
EFTUD2Q15029 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.433e-8■■■■■ 48.2
EFTUD2Q15029 MAP2K7-207ENST00000494348 724 ntTSL 513.25□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 48.2
EFTUD2Q15029 CSNK1G2-204ENST00000589350 780 ntTSL 516.39■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 48.2
EFTUD2Q15029 MBD6-204ENST00000547545 1884 ntTSL 1 (best)20.08■□□□□ 0.817e-7■■■■■ 48.2
EFTUD2Q15029 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.061e-8■■■■■ 48.2
EFTUD2Q15029 HBP1-208ENST00000468410 2704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.051e-8■■■■■ 48.2
EFTUD2Q15029 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.161e-8■■■■■ 48.2
EFTUD2Q15029 CXXC1-207ENST00000586837 838 ntTSL 517.71■□□□□ 0.434e-9■■■■■ 48.2
EFTUD2Q15029 SCLY-213ENST00000450965 1918 ntTSL 1 (best)16.92■□□□□ 0.31e-8■■■■■ 48.2
EFTUD2Q15029 CXXC1-211ENST00000589548 849 ntTSL 316.46■□□□□ 0.234e-9■■■■■ 48.2
EFTUD2Q15029 SCLY-215ENST00000480357 5668 ntTSL 1 (best)15.63■□□□□ 0.091e-8■■■■■ 48.2
EFTUD2Q15029 SCLY-209ENST00000437134 760 ntTSL 515.49■□□□□ 0.071e-8■■■■■ 48.2
EFTUD2Q15029 SCLY-203ENST00000412508 585 ntTSL 215.39■□□□□ 0.051e-8■■■■■ 48.2
EFTUD2Q15029 SCLY-208ENST00000433750 660 ntTSL 214.65□□□□□ -0.061e-8■■■■■ 48.2
EFTUD2Q15029 UBE2F-SCLY-202ENST00000449891 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.02□□□□□ -0.161e-8■■■■■ 48.2
EFTUD2Q15029 SCLY-214ENST00000463433 916 ntTSL 57.82□□□□□ -1.161e-8■■■■■ 48.2
EFTUD2Q15029 PTS-203ENST00000525645 1069 ntTSL 1 (best)13.29□□□□□ -0.281e-8■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 NAPRT-201ENST00000340490 1774 ntTSL 1 (best)25.23■■□□□ 1.633e-7■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.313e-7■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.743e-7■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.643e-7■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 HMGN1-217ENST00000489072 1014 ntTSL 323.64■■□□□ 1.372e-22■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 HMGN1-206ENST00000431390 1552 ntTSL 318.31■□□□□ 0.522e-22■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 HMGN1-207ENST00000436324 1045 ntTSL 217.34■□□□□ 0.372e-22■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 HMGN1-219ENST00000491183 527 ntTSL 216.87■□□□□ 0.292e-22■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.162e-22■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 HMGN1-210ENST00000464078 508 ntTSL 516■□□□□ 0.152e-22■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 HMGN1-209ENST00000463631 583 ntTSL 316■□□□□ 0.152e-22■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 HMGN1-214ENST00000482733 701 ntTSL 215.97■□□□□ 0.152e-22■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 HMGN1-212ENST00000479586 841 ntTSL 215.85■□□□□ 0.132e-22■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.132e-22■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 HMGN1-216ENST00000486741 4299 ntTSL 213.69□□□□□ -0.222e-22■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 HMGN1-208ENST00000443046 823 ntTSL 313.24□□□□□ -0.292e-22■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 HMGN1-220ENST00000492280 2707 ntTSL 513.13□□□□□ -0.312e-22■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 HMGN1-202ENST00000380747 709 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.992e-22■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 HMGN1-201ENST00000288344 1303 ntTSL 28.78□□□□□ -12e-22■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 HMGN1-205ENST00000419378 850 ntTSL 26.57□□□□□ -1.362e-22■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.065e-11■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 TMEM87A-203ENST00000448392 3049 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.885e-11■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 TMEM87A-202ENST00000389834 3109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.965e-11■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 TMEM87A-205ENST00000562946 1430 ntTSL 28.35□□□□□ -1.075e-11■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 TMEM87A-213ENST00000569075 1369 ntTSL 25.31□□□□□ -1.565e-11■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 MCM7-210ENST00000489841 2515 ntTSL 1 (best)10.59□□□□□ -0.712e-7■■■■■ 48.1
EFTUD2Q15029 TRMT1-222ENST00000593157 2127 ntTSL 220.92■□□□□ 0.942e-7■■■■■ 48
EFTUD2Q15029 TRMT1-211ENST00000588511 2251 ntTSL 520.63■□□□□ 0.892e-7■■■■■ 48
EFTUD2Q15029 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 48
EFTUD2Q15029 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 48
EFTUD2Q15029 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 48
EFTUD2Q15029 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 48
EFTUD2Q15029 EDC4-212ENST00000576972 747 ntTSL 314.7□□□□□ -0.064e-9■■■■■ 48
EFTUD2Q15029 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.023e-11■■■■■ 48
EFTUD2Q15029 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.273e-11■■■■■ 48
EFTUD2Q15029 PITRM1-204ENST00000424714 482 ntTSL 312.95□□□□□ -0.343e-11■■■■■ 48
EFTUD2Q15029 PITRM1-207ENST00000451454 875 ntTSL 312.61□□□□□ -0.393e-11■■■■■ 48
EFTUD2Q15029 PITRM1-202ENST00000380989 3487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.463e-11■■■■■ 48
EFTUD2Q15029 PITRM1-209ENST00000464395 3240 ntTSL 1 (best)11.5□□□□□ -0.573e-11■■■■■ 48
EFTUD2Q15029 PITRM1-203ENST00000380994 2579 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.653e-11■■■■■ 48
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