Protein–RNA interactions for Protein: Q14527

HLTF, Helicase-like transcription factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLTFQ14527 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.382e-6■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 ZFYVE16-211ENST00000512558 4496 ntTSL 25.72□□□□□ -1.492e-6■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 ZFYVE16-207ENST00000510995 2873 ntTSL 1 (best)4.32□□□□□ -1.722e-6■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.752e-6■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.882e-6■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.174e-6■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.874e-6■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.844e-6■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.344e-6■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 LINC00969-201ENST00000414625 729 ntTSL 515.56■□□□□ 0.082e-6■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 LINC00969-244ENST00000602127 749 ntTSL 514.07□□□□□ -0.162e-6■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.162e-6■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 LINC00969-313ENST00000628917 490 ntTSL 514.07□□□□□ -0.162e-6■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 LINC00969-217ENST00000451982 1161 ntTSL 513.63□□□□□ -0.232e-6■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.382e-6■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 NBR2-202ENST00000460115 1344 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.483e-9■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 NBR2-203ENST00000467245 1158 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.873e-9■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 NBR2-201ENST00000356906 978 ntTSL 1 (best)8.32□□□□□ -1.083e-9■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 CASC19-271ENST00000641968 842 nt5.6□□□□□ -1.513e-8■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 FBXL13-203ENST00000379308 2577 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.52e-7■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 FBXL13-202ENST00000379305 2478 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.852e-7■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 FBXL13-206ENST00000448002 2582 ntTSL 1 (best)9.72□□□□□ -0.852e-7■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.992e-7■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.082e-7■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 FBXL13-211ENST00000477915 743 ntTSL 56.95□□□□□ -1.32e-7■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.512e-7■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.762e-7■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.214e-6■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.74e-6■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.084e-6■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 REST-209ENST00000622863 1106 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.054e-6■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.114e-6■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 JMJD1C-201ENST00000327520 3781 ntTSL 22.64□□□□□ -1.999e-7■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 VPS13A-208ENST00000423463 2702 ntTSL 22.84□□□□□ -1.962e-7■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.586e-7■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.566e-7■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.636e-7■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 DGKD-203ENST00000427930 482 ntTSL 514.96□□□□□ -0.014e-6■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 DGKD-213ENST00000490764 2902 ntTSL 1 (best)14.18□□□□□ -0.144e-6■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 DGKD-209ENST00000472732 506 ntTSL 56.66□□□□□ -1.344e-6■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 DGKD-206ENST00000447484 494 ntTSL 36.44□□□□□ -1.384e-6■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.16e-7■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 PUM2-204ENST00000403432 3594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.416e-7■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.226e-7■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.296e-7■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 PUM2-209ENST00000440577 4352 ntTSL 1 (best)6.67□□□□□ -1.346e-7■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.461e-7■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.911e-7■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.941e-7■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 KTN1-208ENST00000459737 4793 ntTSL 1 (best)2.48□□□□□ -2.011e-7■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.031e-7■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.051e-7■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.111e-7■■■□□ 15.2
HLTFQ14527 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.252e-7■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 AL590004.4-201ENST00000566733 7060 ntBASIC10.18□□□□□ -0.782e-6■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 SPECC1L-203ENST00000421374 2565 ntTSL 217.68■□□□□ 0.421e-7■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 SPECC1L-202ENST00000416735 566 ntTSL 412.18□□□□□ -0.461e-7■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 EHBP1-204ENST00000405482 1311 ntTSL 222.37■■□□□ 1.177e-7■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 EHBP1-211ENST00000449820 539 ntTSL 58.83□□□□□ -17e-7■■■□□ 15.1
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HLTFQ14527 AC007780.1-201ENST00000590353 719 ntTSL 49.55□□□□□ -0.885e-7■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 AC007780.1-202ENST00000591567 549 ntTSL 46.21□□□□□ -1.425e-7■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.922e-6■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 DDAH1-201ENST00000284031 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.092e-6■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 DDAH1-202ENST00000426972 4017 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.032e-6■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 DDAH1-203ENST00000483110 3905 ntTSL 1 (best)5.96□□□□□ -1.452e-6■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.462e-6■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.462e-6■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 DLEU1-227ENST00000484869 1652 ntTSL 59.2□□□□□ -0.941e-6■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 DLEU1-221ENST00000479420 612 ntTSL 56.46□□□□□ -1.381e-6■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 MAGI1-211ENST00000479287 556 ntTSL 54.45□□□□□ -1.73e-6■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 PTBP2-209ENST00000482253 2029 ntTSL 219.9■□□□□ 0.782e-6■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 PTBP2-205ENST00000460706 1129 ntTSL 211.57□□□□□ -0.562e-6■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 PTBP2-201ENST00000370197 3057 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.892e-6■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 PTBP2-202ENST00000370198 3054 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.012e-6■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 PTBP2-207ENST00000476419 1691 ntTSL 1 (best)8.35□□□□□ -1.072e-6■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.082e-6■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.822e-6■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 MACF1-230ENST00000530275 5767 nt14.91□□□□□ -0.022e-6■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.033e-10■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 SHANK3-202ENST00000414786 7394 ntTSL 521.46■■□□□ 1.033e-10■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.483e-10■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 CHPT1-203ENST00000546873 624 ntTSL 37.27□□□□□ -1.251e-6■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 ERV3-1-201ENST00000394323 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.119e-7■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 ZNF117-202ENST00000487644 1837 ntTSL 25.29□□□□□ -1.569e-7■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.988e-7■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.748e-7■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 TRAPPC12-206ENST00000417243 1047 ntTSL 512.58□□□□□ -0.48e-7■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 TRAPPC12-207ENST00000433382 578 ntTSL 512.27□□□□□ -0.458e-7■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 TRAPPC12-204ENST00000415624 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.05□□□□□ -0.648e-7■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 N4BP2-203ENST00000513269 5361 ntTSL 1 (best)8.35□□□□□ -1.076e-7■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.293e-6■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 MACF1-205ENST00000372925 14496 ntTSL 56.69□□□□□ -1.343e-6■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.543e-6■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.643e-6■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.683e-6■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.181e-7■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 RBM12B-208ENST00000627241 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.461e-7■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 RBM12B-202ENST00000517700 6001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.731e-7■■■□□ 15.1
HLTFQ14527 RBM12B-206ENST00000520961 507 ntTSL 36.17□□□□□ -1.421e-7■■■□□ 15.1
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