Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRPF4BQ13523 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
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