Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 MIEN1-206ENST00000582963 1999 nt21.09■□□□□ 0.976e-8■■■■■ 33.9
PABPC4Q13310 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.966e-8■■■■■ 33.9
PABPC4Q13310 MIEN1-203ENST00000474210 706 ntTSL 220.22■□□□□ 0.836e-8■■■■■ 33.9
PABPC4Q13310 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.088e-7■■■■■ 33.9
PABPC4Q13310 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.048e-7■■■■■ 33.9
PABPC4Q13310 LAMP2-204ENST00000486593 1069 ntTSL 59.7□□□□□ -0.868e-7■■■■■ 33.9
PABPC4Q13310 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.058e-7■■■■■ 33.9
PABPC4Q13310 CYC1-204ENST00000533444 1832 ntTSL 1 (best)29.67■■■□□ 2.345e-18■■■■■ 33.9
PABPC4Q13310 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.845e-18■■■■■ 33.9
PABPC4Q13310 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.847e-8■■■■■ 33.9
PABPC4Q13310 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.576e-9■■■■■ 33.8
PABPC4Q13310 ZNF496-203ENST00000462139 9243 ntTSL 1 (best)11.49□□□□□ -0.576e-9■■■■■ 33.8
PABPC4Q13310 ZNF496-202ENST00000461277 3857 ntTSL 1 (best)9.07□□□□□ -0.966e-9■■■■■ 33.8
PABPC4Q13310 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.017e-9■■■■■ 33.8
PABPC4Q13310 GAB2-201ENST00000340149 6052 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.267e-9■■■■■ 33.8
PABPC4Q13310 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.724e-13■■■■■ 33.8
PABPC4Q13310 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.161e-323■■■■■ 33.8
PABPC4Q13310 PHC2-210ENST00000485928 2548 ntTSL 224.85■■□□□ 1.572e-17■■■■■ 33.7
PABPC4Q13310 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.552e-17■■■■■ 33.7
PABPC4Q13310 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.272e-17■■■■■ 33.7
PABPC4Q13310 PHC2-203ENST00000373422 2799 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.372e-17■■■■■ 33.7
PABPC4Q13310 PHC2-204ENST00000431992 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.472e-17■■■■■ 33.7
PABPC4Q13310 MAP7D1-202ENST00000373148 1797 ntTSL 231.66■■■□□ 2.661e-6■■■■■ 33.7
PABPC4Q13310 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.181e-6■■■■■ 33.7
PABPC4Q13310 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 33.7
PABPC4Q13310 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 33.7
PABPC4Q13310 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.561e-14■■■■■ 33.7
PABPC4Q13310 CUEDC2-202ENST00000465409 896 ntTSL 215.65■□□□□ 0.11e-14■■■■■ 33.7
PABPC4Q13310 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.286e-8■■■■■ 33.7
PABPC4Q13310 CCDC124-202ENST00000596123 580 ntTSL 215.17■□□□□ 0.021e-9■■■■■ 33.7
PABPC4Q13310 EEF1B2-207ENST00000445505 515 ntTSL 521.03■□□□□ 0.961e-49■■■■■ 33.6
PABPC4Q13310 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.611e-49■■■■■ 33.6
PABPC4Q13310 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.551e-49■■■■■ 33.6
PABPC4Q13310 EEF1B2-210ENST00000479587 701 ntTSL 218.17■□□□□ 0.51e-49■■■■■ 33.6
PABPC4Q13310 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.271e-49■■■■■ 33.6
PABPC4Q13310 EEF1B2-205ENST00000429769 912 ntTSL 514.18□□□□□ -0.141e-49■■■■■ 33.6
PABPC4Q13310 EEF1B2-204ENST00000415904 649 ntTSL 313.59□□□□□ -0.231e-49■■■■■ 33.6
PABPC4Q13310 EEF1B2-209ENST00000460760 1025 ntTSL 213.53□□□□□ -0.241e-49■■■■■ 33.6
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PABPC4Q13310 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.53e-7■■■■■ 33.6
PABPC4Q13310 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.983e-7■■■■■ 33.6
PABPC4Q13310 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.082e-9■■■■■ 33.6
PABPC4Q13310 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.872e-9■■■■■ 33.6
PABPC4Q13310 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.842e-9■■■■■ 33.6
PABPC4Q13310 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.542e-9■■■■■ 33.6
PABPC4Q13310 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.482e-9■■■■■ 33.6
PABPC4Q13310 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.22e-9■■■■■ 33.6
PABPC4Q13310 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.132e-9■■■■■ 33.6
PABPC4Q13310 CCT4-202ENST00000461370 388 ntTSL 25.72□□□□□ -1.494e-7■■■■■ 33.6
PABPC4Q13310 NOP53-202ENST00000594182 303 ntTSL 318.4■□□□□ 0.544e-10■■■■■ 33.6
PABPC4Q13310 HEXA-204ENST00000564677 572 ntTSL 215.93■□□□□ 0.143e-21■■■■■ 33.5
PABPC4Q13310 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.143e-21■■■■■ 33.5
PABPC4Q13310 HEXA-211ENST00000567411 1743 ntTSL 515.64■□□□□ 0.093e-21■■■■■ 33.5
PABPC4Q13310 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.043e-21■■■■■ 33.5
PABPC4Q13310 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.23e-21■■■■■ 33.5
PABPC4Q13310 HEXA-205ENST00000565873 721 ntTSL 212.88□□□□□ -0.353e-21■■■■■ 33.5
PABPC4Q13310 RASSF1-207ENST00000482447 1711 ntTSL 1 (best)25.51■■□□□ 1.673e-8■■■■■ 33.4
PABPC4Q13310 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.323e-8■■■■■ 33.4
PABPC4Q13310 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.043e-8■■■■■ 33.4
PABPC4Q13310 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.033e-8■■■■■ 33.4
PABPC4Q13310 RASSF1-204ENST00000395117 1745 ntTSL 221.24■□□□□ 0.993e-8■■■■■ 33.4
PABPC4Q13310 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.923e-8■■■■■ 33.4
PABPC4Q13310 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.523e-8■■■■■ 33.4
PABPC4Q13310 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.781e-9■■■■■ 33.4
PABPC4Q13310 RPL28-202ENST00000426763 5620 ntTSL 1 (best)15.64■□□□□ 0.091e-9■■■■■ 33.4
PABPC4Q13310 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.046e-12■■■■■ 33.4
PABPC4Q13310 NDUFS7-211ENST00000539882 555 ntTSL 419.84■□□□□ 0.776e-9■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 RBBP5-202ENST00000367164 4290 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.862e-7■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 RBBP5-201ENST00000264515 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 PITRM1-211ENST00000490510 778 ntTSL 223.27■■□□□ 1.325e-18■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.075e-18■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.215e-18■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 PITRM1-202ENST00000380989 3487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.45e-18■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 PITRM1-209ENST00000464395 3240 ntTSL 1 (best)12.07□□□□□ -0.485e-18■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 PITRM1-203ENST00000380994 2579 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.585e-18■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.098e-7■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.428e-7■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.058e-7■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.68e-7■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.578e-7■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.498e-7■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 AC073111.4-201ENST00000483664 582 ntTSL 415.89■□□□□ 0.138e-7■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 UBC-213ENST00000546120 718 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.668e-83■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.011e-11■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 SMIM7-216ENST00000598278 603 ntTSL 313.37□□□□□ -0.271e-11■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 AC008764.4-204ENST00000595505 400 ntTSL 212.03□□□□□ -0.481e-11■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 SMIM7-206ENST00000465250 1281 ntTSL 211.98□□□□□ -0.491e-11■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 SMIM7-207ENST00000481671 1126 ntTSL 211.68□□□□□ -0.541e-11■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 AC008764.4-206ENST00000594509 479 ntTSL 211.47□□□□□ -0.571e-11■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 SMIM7-221ENST00000627144 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.61e-11■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 SMIM7-209ENST00000487803 2190 ntTSL 1 (best)11.33□□□□□ -0.61e-11■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 SMIM7-213ENST00000594662 1076 ntTSL 211.25□□□□□ -0.611e-11■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 SMIM7-211ENST00000593409 1757 ntTSL 511.02□□□□□ -0.651e-11■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 AC008764.4-201ENST00000593962 468 ntTSL 210.63□□□□□ -0.711e-11■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 SMIM7-208ENST00000487416 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.761e-11■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 AC008764.4-205ENST00000593459 222 ntAPPRIS P1 TSL 39.8□□□□□ -0.841e-11■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 SMIM7-215ENST00000597781 975 ntTSL 28.99□□□□□ -0.971e-11■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 AC008764.4-202ENST00000601636 437 ntTSL 37.97□□□□□ -1.131e-11■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 AC008764.4-203ENST00000593991 548 ntTSL 27.17□□□□□ -1.261e-11■■■■■ 33.3
PABPC4Q13310 SMIM7-210ENST00000593404 1065 ntTSL 25.83□□□□□ -1.481e-11■■■■■ 33.3
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